肉身殿是典型的宫殿式建筑，坐落于九华山街西神光岭头，周围古木参天，浓荫蔽空。殿宇高15米，山门西南，红墙森严，巍峨雄壮。入殿须登八十一级台阶。站在台阶之下，举引仰望，可见南门厅上方有两块横额。上额书“肉身宝殿”四字，楷书，竖匾四周镶饰立体花边，无署款;下额书“东南第一山”五字，行书，民国八年(1919年)闰七月青阳人施玉藻题。上署“浙江慈裕县信士董东海、董东福久感地藏王威灵，以助夙愿。”
殿前的东西厢房，底层均有房间。入内如平步登楼。东厢数间，为客堂和僧人寮房。西边数间，原为“佛教文物陈列室”。
殿宇面阔3间，进深16米，地平铺汉白玉石。中央为1.8米高的汉白玉塔基，上矗七层八方木质宝塔一座，高17米。塔的每层八面背有佛龛，每龛均供奉金地藏金色坐像，供56尊，大小不一，以漆芋合塑造于清光绪十二年(1886年)。在塔北门外有个半月形瑶台，台上铸有三座大鼎。其一，置肉身殿北拜台东侧，高120厘米，口径109厘米;其二，置肉宝殿北拜台中，高120厘米，口径109厘米;其三，置肉身殿北拜台西侧，高120厘米，口径109厘米，此处比殿南正门前开阔得多，香客多到此烧香拜佛。
明万历年间朝廷赐银重修塔殿，赐额“护国肉身宝塔”。清康熙二十二年(1683年)池州喻成龙重修殿宇，正殿大门朝北，建有84级台阶。咸丰七年(1857年)大部分殿宇遭兵燹。同治初山洪冲倒殿宇，继又重建。光绪十二年(1886年)开肉身塔大规模重修，移殿门正南向，门额悬挂“东南第一山”横匾。殿南陡建8l级台阶。1914年殿宇重修。1917年黎元洪书赠“地藏大愿”匾额。1944-1946年住持僧化雨。1947-1949年住持僧宝严。
1955年和1981年又两次重修。该寺殿宇宏伟，是塔殿式建筑，上盖铁瓦，四角有宫殿式翘檐。殿内汉白玉辅地，塔基上建有七层八方木塔，每层木塔有佛龛供地藏菩萨佛像。全寺建筑面积705平方米。为安徽省重点文物保护单位，全国汉族地区佛教重点寺院。
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